Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ascl4M0QW46 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ascl4M0QW46 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ascl4M0QW46 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ascl4M0QW46 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ascl4M0QW46 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ascl4M0QW46 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl4M0QW46 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms