Protein–RNA interactions for Protein: L7N298

Gm3424, Predicted gene 3424, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3424L7N298 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3424L7N298 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms