Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20939L7N243 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms