Protein–RNA interactions for Protein: K9J7E2

Gm4312, Predicted gene 4301, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4312K9J7E2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4312K9J7E2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4312K9J7E2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4312K9J7E2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4312K9J7E2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4312K9J7E2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4312K9J7E2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4312K9J7E2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4312K9J7E2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4312K9J7E2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4312K9J7E2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4312K9J7E2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4312K9J7E2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4312K9J7E2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4312K9J7E2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4312K9J7E2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm4312K9J7E2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4312K9J7E2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms