Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccer2J3QPU5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms