Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20795J3QP49 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20795J3QP49 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20795J3QP49 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20795J3QP49 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20795J3QP49 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20795J3QP49 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20795J3QP49 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20795J3QP49 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20795J3QP49 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20795J3QP49 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20795J3QP49 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20795J3QP49 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20795J3QP49 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20795J3QP49 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20795J3QP49 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20795J3QP49 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20795J3QP49 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20795J3QP49 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20795J3QP49 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20795J3QP49 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20795J3QP49 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20795J3QP49 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20795J3QP49 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20795J3QP49 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20795J3QP49 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20795J3QP49 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20795J3QP49 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms