Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms