Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c2J3QNM1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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