Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms