Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms