Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4bG5E8Z2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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