Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Vmn1r58G3X9U3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms