Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arfgef1G3X9K3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms