Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nccrp1G3X9C2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nccrp1G3X9C2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms