Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
2610008E11RikG3X964 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms