Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccl26F8VQM2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl26F8VQM2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms