Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srp72F8VQC1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms