Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5160F8VPN3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms