Protein–RNA interactions for Protein: F7CXE4

Gm7535, Predicted gene 7535, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7535F7CXE4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm7535F7CXE4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7535F7CXE4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms