Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Igkv1-99F6XWB2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms