Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm17555F6U8B9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm17555F6U8B9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm17555F6U8B9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm17555F6U8B9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm17555F6U8B9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm17555F6U8B9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm17555F6U8B9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm17555F6U8B9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm17555F6U8B9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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