Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm10477F6SW83 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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