Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms