Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Defa35E9QLQ1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Defa35E9QLQ1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Defa35E9QLQ1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Defa35E9QLQ1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms