Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ankrd35E9Q9D8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd35E9Q9D8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd35E9Q9D8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd35E9Q9D8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd35E9Q9D8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd35E9Q9D8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd35E9Q9D8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms