Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7U0

Kcnmb3, Potassium large conductance calcium-activated channel, subfamily M, beta member 3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb3E9Q7U0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnmb3E9Q7U0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnmb3E9Q7U0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnmb3E9Q7U0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnmb3E9Q7U0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms