Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms