Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CenpfE9Q3P4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms