Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
NebE9Q1W3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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