Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3095E9Q058 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms