Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brd1E9PZ26 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms