Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms