Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms