Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R1

Hfm1, Probable ATP-dependent DNA helicase HFM1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hfm1D3Z4R1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hfm1D3Z4R1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hfm1D3Z4R1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms