Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tgfbr3lD3YZZ2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms