Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms