Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cped1B2RX70 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cped1B2RX70 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms