Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usf3B2RUQ2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms