Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt4B2RU40 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms