Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Slc22a28B2RT89 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc22a28B2RT89 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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