Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Brpf1B2RRD7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms