Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbed5B2RPU8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbed5B2RPU8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbed5B2RPU8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbed5B2RPU8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbed5B2RPU8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbed5B2RPU8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zbed5B2RPU8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zbed5B2RPU8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zbed5B2RPU8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zbed5B2RPU8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zbed5B2RPU8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zbed5B2RPU8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zbed5B2RPU8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zbed5B2RPU8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zbed5B2RPU8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Zbed5B2RPU8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Zbed5B2RPU8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Zbed5B2RPU8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Zbed5B2RPU8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Zbed5B2RPU8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms