Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Brpf3B2KF05 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms