Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H60cB1B213 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H60cB1B213 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H60cB1B213 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H60cB1B213 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H60cB1B213 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H60cB1B213 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H60cB1B213 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H60cB1B213 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H60cB1B213 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H60cB1B213 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H60cB1B213 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H60cB1B213 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H60cB1B213 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms