Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CK137956B1AYM9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms