Protein–RNA interactions for Protein: B1AX85

6030498E09Rik, RIKEN cDNA 6030498E09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030498E09RikB1AX85 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
6030498E09RikB1AX85 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
6030498E09RikB1AX85 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
6030498E09RikB1AX85 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
6030498E09RikB1AX85 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
6030498E09RikB1AX85 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
6030498E09RikB1AX85 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
6030498E09RikB1AX85 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
6030498E09RikB1AX85 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
6030498E09RikB1AX85 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
6030498E09RikB1AX85 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms