Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp36B1AQJ2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms