Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms