Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E8

Ttll6, Tubulin polyglutamylase TTLL6, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll6A4Q9E8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll6A4Q9E8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms