Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Odf2A3KGV1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Odf2A3KGV1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms